MySQL se bloquea (algunos punteros pueden no ser válidos y provocar la cancelación del volcado)

Podría considerar modificar estas propiedades del servidor mysql:

nano /etc/mysql/my.cnf

query_cache_size=16M
key_buffer_size=256M

O tal vez incluso intente aumentar el tiempo de ejecución permitido para la consulta del cliente mysql:

SET GLOBAL MAX_STATEMENT_TIME=1000;

antes de ejecutar su consulta.