Mi respuesta llega tarde, pero puede ayudar a futuros lectores.
He tenido el mismo problema. Al leer documentación de MySQL sobre las opciones de comando de MySQL , he descubierto que puedes usar --init-command
parámetro.
Entonces su línea de comando será simplemente:(-v
para detallado y es opcional)
mysql --init-command="SET autocommit=0;" -v < sql_file.sql