Las principales diferencias entre ellos son:
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mysql-connector-repackaged:es antiguo, no lo use
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mysql-connector-python 2.0.4:es el original cargado por MySQL. Pero tiene el problema de que no funciona con Django>=1.8. MySQL aún no subió su versión estable 2.1.3 a este repositorio.
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mysql-connector-python-rf 2.1.3:es la solución a todos tus problemas si usas Django>=1.8