Definitivamente es posible ejecutar WordPress conectándose a MS SQL Server. Estamos ejecutando una instancia de este tipo en producción en mi empresa. Aquí hay dos publicaciones que describen el proceso de usar WordPress con MS SQL Server e IIS. Estoy usando una configuración de este tipo en este momento en mi caja local.
http://techsugar.wordpress.com/2011/03/02/how-to-install-wordpress-on-iis-7-5-using-sql-server-2008/
http://wordpress.visitmix.com/development/installing-wordpress -en-sql-servidor
