Mysql bench no es necesario para la copia de seguridad automática,
configurar un crontab y usar mysqldump (o equivalente) hará el mismo trabajo y es más fácil.
ejemplo:
crontab -e
/* backup every day at 00:00:00 */
0 0 * * * mysqldump -u root -ppassword YOUR_DATABASE > /backup/YOUR_DATABASE.sql