Parece que usas InnoDB tablas, por lo que también debe copiar archivos ib* en la carpeta de datos (pero esto sobrescribirá cualquier tabla InnoDB creada en una nueva instalación).
Alternativamente (aún mejor) puede configurar el parámetro 'datadir' en el archivo de configuración y especificar la ruta a la carpeta de datos en la instalación anterior.