Creación dinámica de casillas de verificación

Prueba esto:

<?php 
    //Create the query
    $sql = "SELECT `name` FROM Employees";

    //Run the query
    $query_resource = mysql_query($sql);

    //Iterate over the results that you've gotten from the database (hopefully MySQL)
    while( $employee = mysql_fetch_assoc($query_resource) ):
?>

    <span><?php echo $employee['name']; ?></span>
    <input type="checkbox" name="employees[]" value="<?php echo $employee['name']; ?> /><br />

<?php endwhile; ?>

El ejemplo que ve arriba se basa en dos cosas para funcionar correctamente:

1. Estás usando MySQL
2. Su consulta SQL debe recuperar los nombres de los empleados (para que pueda usarlos en el bucle