Hay es un camino, pero en la etapa el marco es ahora es un camino sin asfaltar. Básicamente, necesitaría escribir un contenedor que se tradujera de SQL a Minimongo de Meteor y viceversa. No es una tarea factible si aún no eres un maestro de Meteor y Mongo.
Hubo intentos de escribir dicho adaptador. El más avanzado que conozco es este:https://github.com/drorm/meteor-sql . Es posible usarlo para jugar, pero no creo que esté listo para la producción. Además, actualmente no forma de usar el sistema de cuentas Meteor con cualquier otra cosa que no sea Mongo. O debe usarlo de todos modos para las cuentas de usuario o renunciar a una gran comodidad que brindan.
Te aconsejo que pruebes Meteor tal como está actualmente, junto con Mongo:es más fácil de lo que piensas. No agrega demasiada curva de aprendizaje y, además de filtrar y actualizar los operadores, no notará que usa una base de datos extraña en absoluto; es como trabajar con objetos Javascript nativos. No hay esquema, ni migraciones, ni se necesita mapeo de objetos. Simplemente toma datos, los pone en una colección y olvida todo lo demás en lo que SQL le hizo pensar.