Creo que ya ejecutaste la migración llamada version_1.0001_initial antes de cambiar el nombre de la aplicación a beta . Todo lo que necesita es actualizar los registros de la base de datos en la tabla django_migrations y cambie el nombre de las migraciones de aplicaciones antiguas al nuevo nombre usando esta instrucción SQL:
UPDATE django_migrations SET app = 'beta' WHERE app = 'version_1';