Es causado por una discrepancia de versión.
En mi sistema, tenía MySQL Connector 6.9.6. Ejecuté el comando en NuGet Package Manager Console:
Install-Package MySql.Data.Entity instala la versión 6.9.8 de forma predeterminada. Su conector debe coincidir con la versión real del paquete NuGet. Puede descargar una versión actualizada del conector desde:https://www.mysql.com/products/connector/
Aquí seleccione el "controlador Ado.net para MySQL" y descargue la versión correspondiente (en este caso, 6.9.8). Vuelva a abrir Visual Studio y ahora el asistente no falla. No es necesario reiniciar.
