Puede usar el DATE_FORMAT función en sus selecciones.
Para la fecha:
'%Y-%m-%d'
Por tiempo:
'%H:%i:%s'
Así que algo como:
UPDATE `table`
SET `datetimecol` = CONCAT_WS(' ', DATE_FORMAT(`datecol`, '%Y-%m-%d'), DATE_FORMAT(`timecol`, '%H:%i:%s'))