Documentos oficiales
$names = array('Frank', 'Todd', 'James'); # Data Array
$this->db->where_in('username', $names); # passing array
Prueba como a continuación
Método 01 (recomendado )
$this->db->from('search_result');
$this->db->where_in('skills',$s_id);
$query = $this->db->get();
Método 02
$this->db->from('search_result');
$this->db->where_in('skills',implode("','",$s_id));
$query = $this->db->get();
Qué está mal en esta línea
$this->db->where_in('skills','".implode("','",$s_id)."');
no ajuste la función con '
o "
cotizaciones. Luego se guardará como valor STRING en DB.
Enlaces