El error no es que no se pueda encontrar la clase. No se permite cargar porque la aplicación web se ha detenido. Sospecho que esto podría estar sucediendo después de reiniciar la aplicación web, donde está inactiva durante un breve período de tiempo. Luego algo de finalize()
El método en el código probablemente esté tratando de hacer una limpieza demasiado tarde. Si eso está o no en su código o en el controlador MySQL, no puedo decirlo. Definitivamente solo debe tener una versión de un jar en un directorio a la vez. Es posible que desee actualizarlo al último
(5.1.15 en este momento) en caso de que se haya solucionado algo que pueda estar afectándote.