Tiene algunas formas de hacerlo, pero tratando de no crear tablas temporales, puede hacer algo así:
select
s.id,
avg(case when sb.id = '01' then s.score end) as math,
avg(case when sb.id = '02' then s.score end) as bio
from student s
join subject sb on (sb.id = s.subject_id)
group by s.id
¡Simplemente complete las líneas de suma/caso para los otros temas que necesite!
Espero que ayude.