Una mejor manera de generar esta matriz json a partir de datos MySql con php

Eliminando toda la redundancia, utilizando declaraciones preparadas adecuadas (asumiendo PDO) y agregando el manejo de errores (al menos un código auxiliar), termina con esto:

$stmt = $conn->prepare('SELECT name, age, address, pincode FROM json WHERE name = ?');
$stmt->execute(array('peter'));

if ($row = $stmt->fetch(PDO::FETCH_ASSOC)) {
    echo json_encode($row);
} else {
    echo json_encode(array('status' => 'error'));
}

Si espera varias filas:

echo json_encode($stmt->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC));