Es posible que tenga algunas declaraciones de inserción grandes que son más grandes que su tamaño máximo. Verifique su archivo /etc/mysql/my.cnf o donde sea que esté. No puedo recordar cuál es el valor predeterminado, pero configurarlo en algo grande como el que se muestra a continuación puede ayudar.
Esta es una opción
[mysqld]
max_allowed_packet = 16M
Y tal vez al revés
[mysqldump]
max_allowed_packet = 16M
