usar PHP para crear una tabla HTML a partir de una consulta MSQL, sin filas duplicadas?

Probablemente lo codificaría así, probablemente no sea la única forma, pero debería funcionar en función de lo que creo que está tratando de lograr. Asegúrese de agregar también "ordenar por" a su consulta SQL.

echo "<table cellspacing='40'>";
$query2 = "SELECT mods.mid, ayr, mtitle, credits FROM stud, smod, mods WHERE stud.sid = '".$_POST['stuNo']."' and stud.sid = smod.sid and smod.mid = mods.mid ORDER BY ayr DESC";

$result = mysql_query($query2) or die(mysql_error());

echo "Enrollment and Progress";
echo "<table width='150' border='1'>";
echo "<tr><td colspan="3"><b>Module Selection</b></td></tr>";
$year = "";
while ($row = mysql_fetch_array($result)) {
    if ($year != $row["ayr"]) {
       echo "<tr><td colspan="3"><b>" . $row["ayr"] . "</b></td></tr>";
       $year = $row["ayr"];
    }
    echo "<tr>";
    echo "<td>" . $row["mid"] . "</td>";
    echo "<td>" . $row["mtitle"] . "</td>";
    echo "<td>" . $row["credits"] . "</td>";
    echo "<tr>";
}
echo "</table>";