No debería haber ningún daño al conectar su aplicación Rails a una base de datos existente. Deberá estar atento a cualquier cosa que vaya en contra de las convenciones de Rails (por ejemplo, los nombres de las tablas son plurales de modelos) y cambiar la base de datos (y su aplicación php) o programar el problema en Rails.
Pero el primer paso es simplemente conectarse a la base de datos y hacer modelos para las tablas existentes y ver qué funciona y qué no.
Después de eso, publique aquí cualquier problema específico.
Como sugerencia, realice una copia de seguridad de su base de datos y comience a programar en base a eso para construir su aplicación y asegurarse de que todo funcione de manera segura.