Cómo restar la fecha y hora actual de la fecha y hora en la base de datos - PHP

Simplemente puede cambiar su declaración de selección para obtener la diferencia de tiempo en segundos, como se muestra a continuación:

$sql  =" select UNIX_TIMESTAMP(current_Timestamp()) - UNIX_TIMESTAMP(time_) FROM test_table WHERE user='john' ORDER BY time_ DESC LIMIT 1" ;