No puede eliminar directamente de la subconsulta, pero aún puede usarlo si lo desea, solo tendrá que usarlo en un JOIN :
DELETE usrs
FROM usrs
INNER JOIN (
SELECT * FROM usrs WHERE name = 'john'
) t ON usrs.Id = t.Id
O podría usar IN :
DELETE usrs
WHERE ID IN (
SELECT ID
FROM usrs
WHERE name = 'John'
)
Dicho esto, para este ejemplo, no sé por qué querrías una subconsulta:
DELETE usrs WHERE name = 'John'
Editar base en comentarios. Para eliminar de varias tablas al mismo tiempo, puede tener múltiples DELETE declaraciones, o puede usar algo como lo siguiente:
delete t1, t2, t3
from (select 'john' as usr) t
left join t1 on t.usr=t1.usr
left join t2 on t.usr=t2.usr
left join t3 on t.usr=t3.usr
