Podría escribir una función que verifique si se marcó una casilla de verificación:
function checkbox_value($name) {
return (isset($_POST[$name]) ? 1 : 0);
}
Ahora llame a esa función en su consulta de esta manera:
$sql = 'UPDATE table SET '.
'checkbox1 = '. checkbox_value('checkbox1') .','.
'checkbox2 = '. checkbox_value('checkbox2') .','.
'checkbox3 = '. checkbox_value('checkbox3') .','.
'checkbox4 = '. checkbox_value('checkbox4') .','.
'checkbox5 = '. checkbox_value('checkbox5') .','. "LIMIT 1";