Puede usar cualquier complemento que permita editar la base de datos a través de JDBC. Necesitará el controlador MySql JDBC (obténgalo aquí ).
Existe el propio Proyecto de herramientas de datos de Eclipse (puede obtenerlo como parte de Paquete BIRT ).
Dos complementos populares son DBViewer y Eclipse SQL Explorer , pero hay muchas otras opciones. La mayoría de estos funcionará.
Personalmente, lo admito, prefiero trabajar con una herramienta nativa, simplemente no me gusta navegar por las tablas dentro de mi IDE (utilizo Secuela Pro , que es solo para Mac).