¿Qué versión de MySQL estás usando? Si es anterior a 5.5, no puede almacenar ese carácter porque tomaría cuatro bytes y MySQL solo admite hasta tres bytes UTF-8 (es decir, caracteres en BMP). MySQL 5.5 agregó soporte para UTF-8 de cuatro bytes, pero debe especificar utf8mb4
como el conjunto de caracteres.
ref:http://dev.mysql.com/doc /refman/5.5/en/charset-unicode.html