También me encontré con este error y resultó que la unidad de disco duro del servidor estaba llena.
Estaba tratando de truncar una tabla. No pude hacerlo a través de la secuencia de comandos web o MySQL Workbench.
Después de agitar mi puño hacia el administrador del servidor, eliminé algunos archivos temporales, ya que tuve que esperar su disponibilidad, y luego pude realizar mi truncado.