Es específico de la instalación, pero si tiene /var/lib/mysql , entonces:
- Las tablas de MyISAM se almacenarán en archivos individuales en /var/lib/mysql/
databasename
//li> - InnoDB reside en /var/lib/mysql/ibdata (a menos que haya utilizado la configuración innodb_per_table, en cuyo caso se almacena como para las tablas MyISAM)