Agregar esta respuesta para el beneficio de futuros buscadores, ya que explica por qué aumentar el tamaño del paquete solucionó el problema:
Extraído de y gracias por publicación de blog de peter_laursen
En OSX 10.7 (Lion), creé un archivo, /etc/my.cnf con el siguiente contenido:
[mysqld]
max_allowed_packet = 12000000
Y luego detuvo el servidor mysql:
/usr/local/bin/mysql.server stop
Cuando se reinició automáticamente, pude ejecutar mis inserciones.