El generador de consultas no inserta marcas de tiempo

Bien. Campos created_at ,update_at y deleted_at son "parte" de Eloquent . Usas Query Builder => la inserción no afecta estos dos campos (created_at y updated_at ). Debe definirlo manualmente como:

$id = DB::table('widgets')
        ->insertGetId(array(
            'creator' => Auth::user()->id,
            'widget_name' => $request->input('widget_name'),
            'pages' => json_encode($request->input('pages')),
            'domain' => $request->input('domain'),
            "settings" => $settings,
            "created_at" =>  \Carbon\Carbon::now(), # new \Datetime()
            "updated_at" => \Carbon\Carbon::now(),  # new \Datetime()
        ));