Si desea eliminar la clave externa si existe y no desea utilizar procedimientos puedes hacerlo de esta manera (para MySQL):
set @var=if((SELECT true FROM information_schema.TABLE_CONSTRAINTS WHERE
CONSTRAINT_SCHEMA = DATABASE() AND
TABLE_NAME = 'table_name' AND
CONSTRAINT_NAME = 'fk_name' AND
CONSTRAINT_TYPE = 'FOREIGN KEY') = true,'ALTER TABLE table_name
drop foreign key fk_name','select 1');
prepare stmt from @var;
execute stmt;
deallocate prepare stmt;
Si hay una clave foránea, ponemos una declaración de modificación de la tabla en la variable y, si no la hay, ponemos una declaración ficticia. Y luego lo ejecutamos.