http://www.maatkit.org/ tiene mk-archiver
Otra alternativa es simplemente crear una nueva tabla de base de datos cada día. MyIsam tiene algunas ventajas para esto, ya que los INSERT al final de la tabla generalmente no se bloquean de todos modos, y hay un tipo de tabla de combinación para volver a estar todos juntos. Varios sitios web registran el tráfico httpd en tablas como esa.
Con Mysql 5.1, también hay tablas de particiones que pueden hacer lo mismo.