¿Qué clase de campo es este? El operador IN no se puede usar con un solo campo, pero está destinado a usarse en subconsultas o con listas predefinidas:
-- subquery
SELECT a FROM x WHERE x.b NOT IN (SELECT b FROM y);
-- predefined list
SELECT a FROM x WHERE x.b NOT IN (1, 2, 3, 6);
Si está buscando una cadena, busque el operador LIKE (pero esto será lento):
-- Finds all rows where a does not contain "text"
SELECT * FROM x WHERE x.a NOT LIKE '%text%';
Si lo restringe para que la cadena que está buscando tenga que comenzar con la cadena dada, puede usar índices (si hay un índice en ese campo) y ser razonablemente rápido:
-- Finds all rows where a does not start with "text"
SELECT * FROM x WHERE x.a NOT LIKE 'text%';