Respuesta parafraseada de Agregar contexto de Historial de migración personalizado ...
EF6 usa un Historial de migración tabla para realizar un seguimiento de los cambios del modelo y garantizar la coherencia entre el esquema de la base de datos y el esquema conceptual. Esta tabla no funciona para MySQL de forma predeterminada porque la clave principal es demasiado grande . Para remediar esta situación, deberá reducir el tamaño de la clave para esa tabla.
Esencialmente, EF6 le permite modificar el tamaño de clave para las columnas de índice de MigrationId/ContextKey usando Fluent API de la siguiente manera:
modelBuilder.Entity<HistoryRow>().Property(h => h.MigrationId).HasMaxLength(100).IsRequired();
modelBuilder.Entity<HistoryRow>().Property(h => h.ContextKey).HasMaxLength(200).IsRequired();
Completado Instrucciones aquí...