Esto es lo que hago para FORZAR EL DESBLOQUEO DE algunas tablas bloqueadas en MySQL
1) Ingrese MySQL
mysql -u your_user -p
2) Veamos la lista de mesas bloqueadas
mysql> show open tables where in_use>0;
3) Veamos la lista de los procesos actuales, uno de ellos está bloqueando su(s) tabla(s)
mysql> show processlist;
4) Matemos uno de estos procesos
mysql> kill put_process_id_here;