Problema con la variable de retorno en bash

Una forma más fácil es:

var=$(mysql -h abcdcef.com --port=3306 --user=root --password=hbbfe --batch --skip-column-names -Dshop -e "select count(*) from shop_tab where catalog <> ''")

Además, preconizaré el uso de la función para agregar fácilmente opciones al comando MySQL sin tener que modificar todo su script.

function MysqlQuery() {
    mysql -h abcdcef.com --port=3306 --user=root --password=hbbfe --batch --skip-column-names -D "$1" -e "$2";
}

va=$(MysqlQuery Shop "SELECT COUNT(*) FROM shop_tab WHERE catalog <> ''")
vaABC=$(MysqlQuery Shop "SELECT COUNT(*) FROM shop_tab WHERE catalog <> 'abc'")
vadef=$(MysqlQuery Shop "SELECT COUNT(*) FROM shop_tab WHERE catalog <> 'def'")
# ...

Encuentro esto más legible también...