como se puede ver aquí https://stackoverflow.com/a/5757054/1393681 el orden es (lon lat).
largo es básicamente el eje y y lat la x si miro mi globo, pero los lon están viajando a lo largo del eje x y los lats a lo largo del eje y así que creo que esa es la razón por la que usas (lon lat)
A pesar de eso, si te mantienes constante en tu aplicación, no debería importar si el mundo está al revés dentro de tu base de datos;-)