¿Realmente depende de la situación?
- ¿Cómo se distribuirán los archivos?
- ¿Los archivos se utilizan de forma independiente o forman parte de un sistema que podría tener su propia lógica de autorización y autenticación?
- ¿Cuál es su estrategia de copia de seguridad?
- ¿Necesita replicación?
- ¿Necesita admitir una gran cantidad de E/S?
- ¿Qué pasa con el almacenamiento en caché?
Habiendo dicho eso, me inclinaría por algún tipo de sistema de archivos para documentos sobre una base de datos.