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Mysql elimina la palabra específica en una cadena separada por comas

Creo que la mejor respuesta a este problema está en el siguiente enlace ¿Cuál es la mejor manera de eliminar el valor del campo SET?

la consulta debe ser así, que cubre el valor o el valor, o solo el valor en la columna separada por comas 

UPDATE yourtable
SET
  categories =
    TRIM(BOTH ',' FROM REPLACE(CONCAT(',', col, ','), ',2,', ','))
WHERE
  FIND_IN_SET('2', categories)

Aquí puede tener su condición en la cláusula where. para obtener más detalles, consulte el enlace anterior.