¿Ya encontró una solución para esto?
El siguiente código funciona para marcar un pedido como completo, pero no ejecuta otras acciones como se describe en el administrador
// create a new checkout instance and order id
$checkout = new WC_Checkout();
$this_order_id = $checkout->create_order();
$order = new WC_Order($this_order_id);
$order->update_status('completed');
