mysql like% consulta es lenta con índice de texto completo

LIKE no utiliza el índice de texto completo. Para hacer uso del índice de texto completo, debe usar la coincidencia (como dijo):

SELECT * 
FROM myTable 
WHERE MATCH(field) AGAINST ('aaa*' IN BOOLEAN MODE)
ORDER BY field2

El Manual de MySQL tiene un capítulo extenso sobre Funciones de búsqueda de texto completo .