Finalmente encontré lo que estaba buscando...
En mi.cnf,
[mysqld_safe]
timezone = UTC
Estaba poniendo esta opción en [mysqld] y mysql no se iniciaba.
Llamando a "SET time_zone='+0:00';" en cada carga de página también funcionaría, pero no me gusta la idea de llamar a esa consulta en cada carga de página.