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Borrar caché de consultas de MySQL sin reiniciar el servidor

Creo que puedes usar...

RESET QUERY CACHE;

...si el usuario con el que está ejecutando tiene derechos de recarga. Alternativamente, puede desfragmentar la caché de consultas a través de...

FLUSH QUERY CACHE;

Consulte Consulta de estado y mantenimiento de caché sección del manual de MySQL para obtener más información.