Rendimiento de inserción por lotes de JDBC

Tuve un problema de rendimiento similar con mysql y lo resolví configurando useServerPrepStmts y las rewriteBatchedStatements propiedades en la URL de conexión.

Connection c = DriverManager.getConnection("jdbc:mysql://host:3306/db?useServerPrepStmts=false&rewriteBatchedStatements=true", "username", "password");