Debería poder aumentar considerablemente la velocidad colocando sus inserciones dentro de una transacción. También puede mover sus declaraciones de preparación y vinculación fuera de su bucle.
$array = array("array", "with", "about", "2000", "values");
$query = "INSERT INTO table (link) VALUES (?)";
$stmt = $mysqli->prepare($query);
$stmt ->bind_param("s", $one);
$mysqli->query("START TRANSACTION");
foreach ($array as $one) {
$stmt->execute();
}
$stmt->close();
$mysqli->query("COMMIT");
Probé este código con 10.000 iteraciones en mi servidor web.
Sin transacción:226 seconds.
Con transacción:2 seconds.
O un two order of magnitude speed increase
, al menos para esa prueba.