Sí, eso es posible, puede usar INSERTAR... EN LA ACTUALIZACIÓN DE CLAVE DUPLICADA.
Usando tu ejemplo:
INSERT INTO table (id,Col1,Col2) VALUES (1,1,1),(2,2,3),(3,9,3),(4,10,12)
ON DUPLICATE KEY UPDATE Col1=VALUES(Col1),Col2=VALUES(Col2);
Sí, eso es posible, puede usar INSERTAR... EN LA ACTUALIZACIÓN DE CLAVE DUPLICADA.
Usando tu ejemplo:
INSERT INTO table (id,Col1,Col2) VALUES (1,1,1),(2,2,3),(3,9,3),(4,10,12)
ON DUPLICATE KEY UPDATE Col1=VALUES(Col1),Col2=VALUES(Col2);