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obteniendo el error Se especificó una URL de Oracle no válida:OracleDataSource.makeURL

Parece que ha dado la URL por error dos veces y el nombre de la propiedad no es correcto.

<property name="Url" value="jdbc:oracle:thin:@127.0.0.1:1521:XE" />  
<property name="URL" value="jdbc:oracle:thin:@127.0.0.1:1521:XE" /> 

debería ser

<property name="url" value="jdbc:oracle:thin:@127.0.0.1:1521:XE" /> 

También sería una buena idea consultar la documentación de glassfish 4.1 para obtener los nombres de propiedad correctos que puede usar en glassfish-resources.xml

Para Glassfish 3.1, las opciones se proporcionan aquí