Campo de fecha incremental automático y versión Oracle sql para una tabla

Creo que tu lógica usa merge y row_number() va por buen camino (aunque, presumiblemente, la partition by no es necesaria la cláusula, ya que ya está filtrando por la ciudad). Lo extendí con lógica adicional para manejar las fechas:

• el effective_dt_from inicial y final effective_dt_to debe dejarse intacto

• en el medio, desea incrementar las fechas día a día a partir de '2017-01-01' .

Consulta:

merge into test t
using (
    select
        t.*,
        row_number() over(order by loc_sid asc) rn,
        count(*) over() cnt
    from test t
    where city = 'Chicago'
) t1
on (t1.loc_sid = t.loc_id)
when matched the update set
    t.version = t1.rn,
    t.effective_dt_from = 
        case 
            when rn = 1 then t.effective_dt_from
            else date '2017-01-01' + rn - 2
        end,
    t.effective_dt_to = 
        case 
            when rn = cnt then t.effective_dt_to
            else date '2017-01-01' + rn - 1
        end