La forma más limpia de construir una cadena SQL en Java

En primer lugar, considere usar parámetros de consulta en declaraciones preparadas:

PreparedStatement stm = c.prepareStatement("UPDATE user_table SET name=? WHERE id=?");
stm.setString(1, "the name");
stm.setInt(2, 345);
stm.executeUpdate();

La otra cosa que se puede hacer es mantener todas las consultas en el archivo de propiedades. Por ejemplo, en un archivo queries.properties puede colocar la consulta anterior:

update_query=UPDATE user_table SET name=? WHERE id=?

Luego, con la ayuda de una clase de utilidad simple:

public class Queries {

    private static final String propFileName = "queries.properties";
    private static Properties props;

    public static Properties getQueries() throws SQLException {
        InputStream is = 
            Queries.class.getResourceAsStream("/" + propFileName);
        if (is == null){
            throw new SQLException("Unable to load property file: " + propFileName);
        }
        //singleton
        if(props == null){
            props = new Properties();
            try {
                props.load(is);
            } catch (IOException e) {
                throw new SQLException("Unable to load property file: " + propFileName + "\n" + e.getMessage());
            }           
        }
        return props;
    }

    public static String getQuery(String query) throws SQLException{
        return getQueries().getProperty(query);
    }

}

puede usar sus consultas de la siguiente manera:

PreparedStatement stm = c.prepareStatement(Queries.getQuery("update_query"));

Esta es una solución bastante simple, pero funciona bien.