Por lo general, las uniones funcionarán más rápido que las consultas internas, pero en realidad dependerá del plan de ejecución generado por SQL Server. No importa cómo escriba su consulta, SQL Server siempre la transformará en un plan de ejecución. Si es lo suficientemente "inteligente" para generar el mismo plan a partir de ambas consultas, obtendrá el mismo resultado.
Aquí y aquí algunos enlaces para ayudar.
