¿Cómo editar mi función php existente y agregar otro cheque?

Utilice un LEFT JOIN con el PREMIUM tabla en su consulta que verifica el tiempo de transferencia. Luego use una coincidencia en esa tabla para condicionar el tiempo con el que compara.

$num_rows = $db->doQuery('
    SELECT Class, Race, Strong, Sta, Dex, Intel, Cha, Points, TransferTime
    FROM USERDATA u
    LEFT JOIN PREMIUM p ON p.strAccountID = u.strUserId
    WHERE strUserId = ?
      AND (TransferTime < IF(p.strAccountId IS NULL,
                             DATEADD(DAY,-2,GETDATE()),
                             DATE_SUB(NOW(), INTERVAL 12 HOUR)))
           OR TransferTime IS NULL)
      AND zone<>199 and authority<>255', $character);