puedes usar sqlcmd
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms162773 .aspx
luego tenga eso en un archivo por lotes y programe a través del programador de Windows
ejemplo a continuación
sqlcmd -E -S localhost -q "select count(1) from databasename.dbo.tablename"
esto se conectará a sql en la máquina local y realizará un recuento de filas en la tabla en la base de datos
