SQL ejecuta Variable +1 hasta que Variable llega a 52?

Si está pensando en términos de bucles, está yendo por el camino equivocado. Debe pensar en términos de lógica basada en conjuntos. Lo que debe hacer es deshacerse de la variable @weeknumber por completo y simplemente agrupar sus datos de manera diferente. Desea agrupar por semanas, por lo que debe calcular el número de semana. Puede hacer esto usando DATEDIFF() y DATEPART(dw,...):

declare @StartDate date
declare @EndDate date
declare @WeekNumber int

set @StartDate = '01/06/2014'
set @EndDate = '07/06/2015'
--set @WeekNumber = 01

select datediff(ww,@startdate,[WeekStartDate])+1 [WeekNumber]
,[WeekStartDate]
,dateadd(dd,6,[WeekStartDate]) [WeekEndDate]
,* 
From (Select t1.LeadSource
                    ,count(t1.prospectid) [Leads]
                    ,sum(t1.Found) [Apps]
                    ,dateadd(dd,2-datepart(dw,t1.CreateDate),t1.CreateDate) WeekStartDate
        from Table T1 
        where t1.CreateDate between @startDate
            and @enddate
GROUP BY f.LeadSource ) f